浏览基因组

资源链接

Nipponbare (O. sativa subgroup. geng/japonica) Genome Browser
The Rice Annotation Project (RAP-DB)
MSU Rice Genome Annotation Project (RGAP)
Rice Information GateWay (RIGW)
RiceENCODE: a comprehensive epigenomic database
Rice Variation Map (RiceVarMap)
Rice Mutant Database (RMD)
Rice SNP-Seek Database (SNP-Seek)
Beijing Genomics Institute Rice Information System
RiceNavi
Oryzabase
MBKbase - Oryza sativa (Rice)
Gramene
The 3,000 rice genomes project (3K R.G.P.)
中国水稻数据中心

资源共享:多家单位共同发布12个代表性水稻铂金标准基因组助力亚洲稻遗传多样性及群体结构研究

2020年4月7日,阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)、亚利桑那大学(UofA)、华中农业大学(HZAU)和国际水稻研究所(IRRI)等多家单位在《Scientific Data》(科学数据)联合发表题为“A platinum standard pan-genome resource that represents the population structure of Asian rice”的研究论文。该国际合作研究团队利用三代PacBio单分子测序技术拼装出12个具有代表性的超高质量亚洲稻基因组,为深入解析亚洲稻遗传多样性、群体结构和种质资源提供了全面的铂金标准参考序列。